Forma-se uma roda, sempre com uma criança do lado de fora. A roda canta:

Pai Francisco entrou na roda

Pai Francisco foi pra prisão.

A menina (ou menino) que ficou fora da roda aproxima-se bem da mesma, requebrando-se toda, enquanto a roda continua:

Desengoçado.

Então a criança que representa o Pai Francisco entra na roda, que lhe dá passagem, e escolhe outra para ser o novo Pai Francisco.
Também há registro de uma versão diferente para o verso final da ronda:

Como ele vem aí